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學(xué)生超算團隊獲國際大獎

作者 : 文磊     編輯 : 張淦    來源 : 計算機學(xué)院     發(fā)布時間 : 2025-03-11 13:58    點擊量:

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3月10日,2025年ASC世界大學(xué)生超級計算機競賽(ASC25)成績公布,我校計算機學(xué)院2022級本科生夏佳如、張志雄、武良山、龔福星、邱鵬組成的學(xué)生超算團隊(指導(dǎo)老師:林培英)最終排名全球第46名,榮獲二等獎。

ASC世界大學(xué)生超級計算機競賽由中國發(fā)起組織,是全球最大規(guī)模的大學(xué)生超算競賽。大賽推動了各國及地區(qū)間超算青年人才交流和培養(yǎng),提升了超算應(yīng)用水平和研發(fā)能力。迄今已舉辦12屆,吸引來自全球上萬名大學(xué)生報名參賽,300余支實力強隊參賽。

ASC25賽題涉及HPC系統(tǒng)設(shè)計、HPL與HPCG基準(zhǔn)測試優(yōu)化、RNA甲基化修飾位點檢測和AlphaFold3推理優(yōu)化,全面考察高性能計算與人工智能融合創(chuàng)新能力。我校超算團隊對業(yè)界優(yōu)化算法進行了系統(tǒng)調(diào)研與深度解析,在超算應(yīng)用分析、性能優(yōu)化等方面展現(xiàn)出超強學(xué)習(xí)能力和實踐能力。

RNA甲基化修飾位點檢測賽題要求對mRNA上的“5-甲基胞嘧啶”(m5C)的修飾位點檢測流程進行性能優(yōu)化。我校超算團隊梳理流程操作步驟、構(gòu)建流程軟件環(huán)境,并完成對三個數(shù)據(jù)集約3億4千萬條測序數(shù)據(jù)的處理,通過一系列并行化方法成功將檢測工作時間由6.5小時縮減到1.5小時,且精確度與相關(guān)性均維持在95%以上。

AlphaFold3推理優(yōu)化賽題要求對AlphaFold3的結(jié)構(gòu)預(yù)測代碼進行優(yōu)化,并需要將代碼從GPU平臺移植到CPU平臺優(yōu)化運行。我校超算團隊成功實現(xiàn)將推理過程遷移至CPU,并針對attention模塊,從einsum算子著手優(yōu)化,在確保預(yù)測精度的前提下,對組委會指定的12組蛋白質(zhì)序列實現(xiàn)高效推理,優(yōu)化了推理使用的XLA內(nèi)核以及并行策略,整體上使AlphaFold3的推理性能平均提升了1.164倍。

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